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En la búsqueda constante de mejorar la competitividad y la rentabilidad en la cadena productiva agrícola, Multiplex y Viroscope, un análisis basado en secuenciación masiva, ha demostrado ser una herramienta fundamental. Este innovador método ofrece ventajas clave para la integración exitosa en la verticalidad productiva de Vivero-Huerto-Exportadora.

Comparación de Costos: Viroscope (HTS) vs qPCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa Cuantitativa)

Un estudio de caso real en Chile muestra cómo dos caminos diferentes, utilizando la metodología HTS y qPCR, abordan temas fitosanitarios en huertos productivos:

HTS (Secuenciación de Alto Rendimiento)

  • Número de Análisis por Año: 10
  • Costo Total por Año: $3 millones
  • Costo Promedio por Análisis: $300.000 pesos

qPCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa Cuantitativa)

  • Número de Análisis por Año: 1.600
  • Costo Total por Año: $24 millones
  • Costo Promedio por Análisis: $15.000

Análisis de Costos y Eficiencia

HTS: El costo inicial por análisis con HTS es significativamente más alto ($300.000), pero ofrece una visión más completa y detallada del material genético, permitiendo la identificación de múltiples patógenos en un solo análisis. Aunque es una inversión alta a corto plazo, resulta más costo-efectiva a largo plazo en situaciones que requieren información de alta certeza.

qPCR: Aunque el costo por análisis de qPCR es más bajo ($15.000 por cada virus), se requiere realizar muchos más análisis, lo que incrementa el riesgo de falsos positivos y falsos negativos. En el ejemplo real, se realizaron 1.600 análisis, lo que resulta en un costo total significativamente más alto.

Ventajas de HTS en el Contexto Agrícola

Diagnóstico Integral: La HTS permite la detección de múltiples patógenos en un solo análisis, eliminando la necesidad de realizar múltiples pruebas separadas como en el caso de la qPCR.

Eficiencia en Recursos: La frecuencia de los análisis con HTS se reduce, simplificando la toma de muestras y minimizando el tiempo empleado en repetidas pruebas, lo que disminuye el riesgo de contaminación cruzada.

Alta Certeza: HTS proporciona mayor precisión y profundidad en el análisis, crucial para el manejo de enfermedades y la mejora de cultivos. Es posible testear todo tipo de tejido, independientemente de la estacionalidad.

Reducción de Errores Diagnósticos: HTS reduce la probabilidad de falsos negativos y positivos en comparación con la qPCR, que puede ser más susceptible a errores por sesgos en el diseño del método.

Consideraciones para la Selección de la Técnica

Costo Inicial vs. Beneficio a Largo Plazo: Aunque HTS tiene un costo inicial más alto por análisis, su capacidad para ofrecer un diagnóstico de alta certeza puede resultar en mayor eficiencia y menores costos a largo plazo.

Ventajas de su Aplicación: La integración de la técnica HTS en la verticalidad productiva de Vivero-Huerto-Exportadora representa una oportunidad única para mejorar la eficiencia, calidad y rentabilidad en todas las etapas de la producción agrícola. En el Vivero, permite un análisis detallado del material de propagación y plantación; en el Huerto, es invaluable para el monitoreo temprano y la detección rápida de enfermedades y plagas; y en la Exportación, es crucial para cumplir con los estrictos requisitos fitosanitarios y de calidad de los mercados internacionales.

Multiplex y Viroscope: Revolucionando la Competitividad y Rentabilidad en la Cadena Productiva Agrícola
Laboratorio Viroscope – Multiplex

Conclusión

Optar por realizar solo 10 análisis anuales con Viroscope (HTS) a un costo total de $3 millones de pesos chilenos ofrece una visión de alta certeza y precisión de los patógenos, resultando más costo-eficiente y rentable en comparación con 1.600 análisis de qPCR, que representan un gasto de más de $20 millones de pesos chilenos. La elección entre HTS y qPCR dependerá de las necesidades específicas del análisis y la capacidad de inversión inicial. No obstante, Viroscope y la secuenciación masiva (HTS) ofrecen un avance significativo en términos de costo-eficiencia, otorgando confianza en la verticalidad de los sistemas productivos Vivero-Huerto-Exportadora y abriendo nuevas oportunidades de competitividad en los mercados.

 

Acerca de Multiplex y Viroscope

Multiplex y Viroscope utilizan biotecnología avanzada para la certificación fitosanitaria mediante diagnóstico molecular por secuenciación. Estas plataformas emplean técnicas de secuenciación masiva y robótica para identificar marcadores moleculares de manera costo-efectiva. Para más información Multiplex, Viroscope.

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